ルビー・サファイアのポケモンの能力値は次のような計算で決められているそうです。

HP:(種族値×2+個体値+努力値÷4)×レベル÷100+レベル+10

HP以外:{(種族値×2+個体値+努力値÷4)×レベル÷100+5}×性格補正

(掛け算割り算のたびに小数は切り捨て)
ヌケニンのHPはこの式に関係なく常に1です。

PCサイト｢POKeDEX 250｣を参考にさせてもらいました。